فرآیند ترخیص کالا گمرکی در چندین مرحله اجرا و عملی می شود که عبارتست از :

1. رسیدن کالا به اماکن گمرکی و دریافت قبض انبار گمرکی
2. تهیه و آماده سازی اسناد
3. اظهار از طریق سامانه EPL
4. دریافت کوتاژ اظهارنامه و تعیین مسیر اظهارنامه( پرینت اظهارنامه)
5. کنترل و ارزیابی کالا
6. دریافت مجوزهای مورد نیاز مانند استاندارد، آزمایشگاه و…
7. کارشناسی(بررسی تعرفه و ارزش اظهارنامه)
8. مرحله صندوق و پرداخت حقوق و عوارض گمرکی
9. مرحله بارگیری و تحویل کالا از انبار گمرک
10. مرحله خروج کالا